Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW3

Mrpl54, 39S ribosomal protein L54, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl54Q9CPW3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl54Q9CPW3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl54Q9CPW3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms