Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ska1Q9CPV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms