Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf2a1Q99PM3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gtf2a1Q99PM3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.3 ms