Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Smim3Q99PE5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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