Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rims1Q99NE5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rims1Q99NE5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms