Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ2

Abtb1, Ankyrin repeat and BTB/POZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abtb1Q99LJ2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Abtb1Q99LJ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Abtb1Q99LJ2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms