Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Usp16Q99LG0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Usp16Q99LG0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms