Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmp1Q99KU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms