Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clint1Q99KN9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Clint1Q99KN9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms