Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rab28Q99KL7 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rab28Q99KL7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms