Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmed9Q99KF1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmed9Q99KF1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms