Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl22Q99JN2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms