Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
SptssbQ925E8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms