Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sf3b5Q923D4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sf3b5Q923D4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sf3b5Q923D4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Sf3b5Q923D4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Sf3b5Q923D4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sf3b5Q923D4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms