Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp3Q91W36 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp3Q91W36 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms