Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ppargc1bQ8VHJ7 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ppargc1bQ8VHJ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms