Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE28

Nkd2, Protein naked cuticle homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd2Q8VE28 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkd2Q8VE28 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkd2Q8VE28 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms