Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam20bQ8VCS3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam20bQ8VCS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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