Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCB1

Ndc1, Nucleoporin NDC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 673 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc1Q8VCB1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndc1Q8VCB1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndc1Q8VCB1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms