Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2K4

Taf6l, TAF6-like RNA polymerase II p300/CBP-associated factor-associated factor 65 kDa subunit 6L, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6lQ8R2K4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Taf6lQ8R2K4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Taf6lQ8R2K4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms