Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r200Q8R281 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Vmn1r200Q8R281 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Vmn1r200Q8R281 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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