Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CipcQ8R0W1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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