Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rnf183Q8QZS5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Rnf183Q8QZS5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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