Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3P5

Cnot6, CCR4-NOT transcription complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot6Q8K3P5 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cnot6Q8K3P5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cnot6Q8K3P5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms