Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3F2

Mmp21, Matrix metalloproteinase-21, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp21Q8K3F2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp21Q8K3F2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp21Q8K3F2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms