Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cdk5rap2Q8K389 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms