Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Abcf3Q8K268 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Abcf3Q8K268 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
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Abcf3Q8K268 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Abcf3Q8K268 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Abcf3Q8K268 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Abcf3Q8K268 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms