Protein–RNA interactions for Protein: Q8K205

Pop1, Processing of 1, ribonuclease P/MRP family, (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,045 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop1Q8K205 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pop1Q8K205 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop1Q8K205 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop1Q8K205 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop1Q8K205 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pop1Q8K205 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms