Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rasgef1bQ8JZL7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rasgef1bQ8JZL7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms