Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NgefQ8CHT1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NgefQ8CHT1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NgefQ8CHT1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NgefQ8CHT1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NgefQ8CHT1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NgefQ8CHT1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms