Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Slc43a2Q8CGA3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Slc43a2Q8CGA3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms