Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ercc8Q8CFD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms