Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Dclre1bQ8C7W7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Dclre1bQ8C7W7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms