Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Col6a6Q8C6K9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Col6a6Q8C6K9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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