Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnot2Q8C5L3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnot2Q8C5L3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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