Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc90bQ8C3X2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc90bQ8C3X2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms