Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssuh2Q8C3L1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssuh2Q8C3L1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms