Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rft1Q8C3B8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rft1Q8C3B8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms