Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atg16l1Q8C0J2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Atg16l1Q8C0J2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Atg16l1Q8C0J2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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