Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Lrtm1Q8BXQ3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lrtm1Q8BXQ3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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