Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rbbp5Q8BX09 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms