Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Snx17Q8BVL3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Snx17Q8BVL3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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