Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem260Q8BMD6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms