Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy1Q8BIJ7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms