Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atg4dQ8BGV9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atg4dQ8BGV9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms