Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ubash3bQ8BGG7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubash3bQ8BGG7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubash3bQ8BGG7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms