Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sv2bQ8BG39 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms