Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc50Q810U5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc50Q810U5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms