Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Liat1Q810M6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Liat1Q810M6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms