Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Clec18aQ7TSQ1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Clec18aQ7TSQ1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms